U mnie wszystko prosto się robiło.
Ściągnąłem patcha, nacisnąłem setup, później mi się instalowało (dosyć długo, bo dużo plików musiało się wgrać na dysk) i odpaliłem i wszystko grało.
Jedynie musiałem instalować jeszcze raz PES-a, ale to dlatego, że przez odinstalowanie poprzedniego patcha usunął mi się .exe i jeszcze kilka plików, a tak to wszystko jest OK.
Jeżeli chodzi o osobne exe - patch jest zrobiony jak osobna gra, jest osobne exe i nawet settings.
A co do linku to może jest zły (może dałem inny niż ten z którego ściągałem), bo pamiętam, że musiałem długo szukać tego poprawnego linku, ale wystarczy trochę poszukać i się znajdzie poprawny (lub np. z turbobit, jak ktoś ma premium na przykład, bo na free nie polecam).
PS. Ja usunąłem poprzedniego patcha, bo nie byłem pewny czy patch ma osobne exe, jeżeli ktoś ma taką ochotę to może zostawić swojego teraźniejszego patcha, Ultimate Patch nie koliduje z innymi.